Alemannia Aachen
Zugänge: Sascha Dum (Bayer Leverkusen/ausgeliehen)
Abgänge: Jens Scharping (FC St. Pauli)
VfL Bochum
Zugänge: Fabio Junior (Al Wahda/Vereinigte Arabische Emirate), Thomas Rathgeber (FC Kempten)
Abgänge: Moharram Navidkia (Sepahan Isfahan/Iran/ausgeliehen)
SpVgg Greuther Fürth
Zugänge: Benjamin Fuchs (SpVgg Greuther Fürth II), Jan Mauersberger (Bayern München II/zur Saison 2006/07)
Abgänge: Michael Rundio (TSG Hoffenheim), Tomas Votava (Dresden), Tomislav Erceg (Hajduk Split)
TSV 1860 München
Zugänge: Steffen Hofmann (Rapid Wien)
Abgänge: Christian Holzer (SpVgg Unterhaching), Lance Davids (Djurgarden Stockholm)
Karlsruher SC
Abgänge: Ioannis Masmanidis (Arminia Bielefeld), Christian Kritzer (Jahn Regensburg), Danny Schwarz (1860 München/zur Saison 2006/07)
SC Paderborn
Zugänge: Tom Starke (Bayer Leverkusen), Albert Bunjaku (FC Schaffhausen), Bernhard Erkinger (Red Bull Salzburg), Sebastian Schoof (SF Siegen)
Abgänge: Daniel Cartus (1. FC Eschborn), Daniel Stefulj (Rot-Weiß Essen), Guido Spork (Union Berlin)
Eintracht Braunschweig
Zugänge: Bekim Kastrati (Bor. Mönchengladbach/zur Saison 2006/07)
Abgänge: Martin Amedick (Borussia Dortmund/zur Saison 2006/07)
FC Erzgebirge Aue
Zugänge: Christian Lenze (Eintracht Frankfurt), David Siradze (Lokomotive Tiflis)
Abgänge: Vitus Nagorny (Eintracht Trier), Zvetomir Tchipew (OFI Kreta
SpVgg Unterhaching
Zugänge: Kai Oswald (Karlsruher SC), Nico Frommer (Eintracht Frankfurt), Christian Holzer (TSV 1860 München II)
Abgänge: Necat Aygün (MSV Duisburg), Marijo Maric (VfR Aalen)
Wacker Burghausen
Zugänge: Markus Palionis (Wacker Burghausen II/zur Saison 2006/07)
Abgänge: Senad Tiganj, Tobias Fink (beide Jahn Regensburg), Özgür Kart (Hamburger SV II/ausgeliehen)
Hansa Rostock
Zugänge: Enrico Kern (Jahn Regensburg), Tobias Rathgeb (VfB Stuttgart), Djordjije Cetkovic (FK Vozdovac Belgrad)
SF Siegen
Zugänge: Benedict Akwuegbu (FC Wacker Tirol), Cafú (Boavista Porto)
Abgänge: Sebastian Schoof (Paderborn)
Kickers Offenbach
Zugänge: Toni Tapalovic (KFC Uerdingen), Matej Miljatovic (NK Ptuj), Heiner Backhaus (Arminia Bielefeld)
1. FC Saarbrücken
Zugänge: Jonathan Jager (Le Havre) Alexis Genet (Olympique Lyon), Marcel Mahouvé (vereinslos), Chadlij Amri, Clement Halet (beide 1. FC Saarbrücken II), Ivan Dudic (Östers IF/Schweden)
Abgänge: Gunter Thiebaut (Belgien), Faysal El Idrissi (Al Nasr/Dubai), Peter Buljan, Christian Stuff (beide Eintracht Trier)
Dynamo Dresden
Zugänge: Ivo Ulich (Bor. Mönchengladbach), Maik Wagefeld (1. FC Nürnberg), Tomas Votava (SpVgg Greuther Fürth), Jan Koziak (Banska Bystrica/Slowakei), Pavel Pergl (Sparta Prag/ausgeliehen)
Abgänge: Ansgar Brinkmann (Preußen Münster), Tomislav Stanic (Inter Zapresic), Joshua Kennedy (1. FC Nürnberg/zur Saison 2006(07)
LR Ahlen
Zugänge: Ranislav Jovanovic (FSV Mainz 05), Jesus Brahaman Sinisterra Arias, Jean-Clotaire Tsoumou-Madza (MPPJ Selangor/Malysia)
Abgänge: Sasa Radulovic (FC Augsburg), Paulinho (AC Lugano, Marcel Ketelaer (SV Pasching)[/u]
